由于旋流燃烧器靠卷吸周围的热烟气来点燃煤粉，与周围燃烧器关系不大，因此旋流燃烧器可对单个燃烧器进行试验，单独进行优化调整。旋流燃烧器在运行中，主要调节其出口气流的中心回流量、气流的射程和气流的扩散角。
蜗壳式旋流燃烧器一般通过调整燃烧器入口的舌形挡板进行气流调节。旋转射流中心回流区的长度随旋流强度的增大而变长，宽度随旋流强度的增大而增大 ；旋转射流的射程随旋流强度的增大而减小；旋转射流的扩散角随旋流强度的增大而增大。因此，在运行调整中，对扩散角、射程和回流区三者应综合考虑。根据相应的煤种适当调节旋流强度，在负荷低时或煤质差灰分大时，可适当关小轴向挡板，以取得较大的旋流强度，改善燃烧器着火状况 ；当负荷高或煤质达到设计标准时，可适当开大轴向挡板，避免引起结焦。
双蜗壳燃烧器本身具有一些缺点 ：①气流旋转强度衰减很快，后期煤粉与空气的混合较差 ；②一、二次风阻力较大 ；③ 煤种适应性差 ；④喷燃器出口截面处，煤粉在一次风气流中的分布不均匀；⑤一次风内套管磨穿漏粉造成喷燃器出口射流被破坏、二次风轴向挡板脱落或卡涩，造成二次风调整困难 ；⑥部分喷燃器二次风出口由于上下缘浇注料脱落而造成喷口变形，其垂直方向直径大于水平方向直径，喷口形状由圆形变为椭圆形，出口截面积增大，二次风旋流强度减弱，使得火焰形状发生改变，造成燃烧不稳定。
因此 燃烧器保持适当的一、二、三次风出口速度是建立正常的炉内空气动力场和稳定燃烧所必须的。为合理改善喷燃器着火状况，可着重于一、二次风的协调配合上。过去，由于一次风压采用静压监测，为防止堵管，一次风挡板大部分时间处于全开位置。机组在 DCS 系统改造完毕后，由于加装风粉在线监测装置，运行人员对一次风管的监视由原来的风压变为风速、风粉浓度和风粉温度来完成。这样，对一次风管的风速可以有定量的调整，一次风速过高会推迟着火，过低则易烧损喷燃器，并造成一次风管内的煤粉沉积。
在调整一次风的同时，还必须配合对二次风进行调整。由于二次风速测量值差异较大，只能通过改变二次风门开度，相应改变二次风量。当负荷低或煤质差时，关小二次风门，一方面可提高旋流强度，另一方面，可保证氧量符合要求；当负荷高或煤质好时，开大二次风门，这同改善燃烧、降低飞灰可燃物、保证主汽参数等都是一致的。另外，在现场实际中，由于煤质变化大、一次风内套管磨穿漏粉造成喷燃器出口射流被破坏、二次风轴向挡板脱落或卡涩等原因对燃烧的影响应进行考虑。
